ما الذي يكشفه
يُستعمل تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي (RT-PCR) لتضخيم أجزاء من جينوم فيروس الحمى القلاعية (FMDV) في المواد التشخيصية، وقد طُوّرت له بادئات (primers) خاصة بتحديد النمط المصلي.
العينة
من المواد التي يُضخَّم فيها الجينوم الظهارة والحليب والمصل وعينات البلعوم الفموي (OP)، ويضيف دليل WOAH إليها عضلة القلب من الحالات المصابة بالتهاب العضلة القلبية. ويمكن رصد وجود الفيروس في الدم (viraemia) بفحص عينات المصل بهذا التفاعل أو بعزل الفيروس.
المبدأ
يصف دليل المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) إجراءً لهذا التفاعل يعتمد على الهلام (gel-based)، في حين لا يلزم كشف النواتج على هلام الأغاروز في صيغة التضخيم في الوقت الحقيقي.
متى يُستخدم
يمكن توصيف ناتج التفاعل، شأنه شأن عزلة الفيروس، بتحديد التسلسل (sequencing)، ويُعدّ التضخيم بهذا التفاعل متبوعًا بتحديد تسلسل النيوكليوتيدات الخيار المفضَّل حاليًا لتوليد بيانات التسلسل المستعملة في المقارنة. وتذهب مقارنة التسلسلات الجينومية الكاملة أبعد من ذلك، فتميّز بين الفيروسات شديدة القرابة وتساعد على إعادة بناء مسارات الانتقال بين المزارع داخل الفاشيات. وأشار الدليل إلى أن أنظمة مبسطة من هذا التفاعل، يُحتمل أن تصلح للاستعمال الميداني، قيد التطوير.