يكشف تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي في الوقت الحقيقي (real-time RT-PCR) فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي في الطيور (IBV) باستخدام مسابير نوعية للتسلسل المستهدف، وتظهر نتائجه في أقل من 3 ساعات. تذكر المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) أن هذا التفاعل هو الطريقة الأكثر شيوعًا لفيروس IBV.
ما الذي يكشفه
يستهدف التفاعل العام (generic) لفيروس IBV منطقة محفوظة من الجينوم، مثل المنطقة غير المترجمة 5′ (5′ UTR)، ويمكن استخدامه لكشف الفيروس في العينة السريرية. يمكن أن تُستخدم مع التفاعل العام تفاعلاتٌ خاصة بالأنماط الجينية تستهدف جين S1 للأنماط المعروف انتشارها في المنطقة.
مقارنة بتحليل التسلسل
يختلف التفاعل في الوقت الحقيقي عن المسار الذي يتبع التضخيم بتحليل التسلسل (sequence analysis)، فهو يستغني بمسابير التحلل المائي المتألقة أو الأصباغ المتألقة عن أي معالجة بعد التضخيم، وهي الاستراتيجية التي تذكرها WOAH للتأكيد السريع لوجود IBV. قد يلزم تحديد تسلسل إضافي، بحسب WOAH، لتعريف السلالة المعنية ولتكييف بادئات التفاعلات الخاصة بالأنماط الجينية ومسابيرها، وذلك حين تأتي هذه التفاعلات سلبية والتفاعل العام إيجابيًا.
تفسير النتيجة وحدوده
تشير WOAH إلى أن التباين الكبير بين الأنماط الجينية وتطورها المستمر داخل كل نمط يستلزمان تحديثًا متواصلًا للبادئات والمسابير الخاصة بالأنماط. تذكر WOAH مصدرين محتملين لنتيجة RT-PCR الإيجابية غير وجود IBV في خلايا الكلية وإحداثه الضرر فيها: تفيرس الدم (viraemia)، وتلوث المسحات بأعضاء أخرى غير الكيس الهوائي.