يعرّف تفاعل البوليميراز المتسلسل بالنسخ العكسي (RT-PCR) فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي في الطيور (IBV) على المستوى الجيني، وتعدّ المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) ذلك، مع خدمة التحقيقات الوبائية أثناء الفاشيات، أهم استخداماته. يُستخدم التفاعل أيضًا لكشف الفيروس في السائل اللقانقي المعدي أو في مزارع أعضاء القصبة الهوائية (TOCs)، إذ تذكر WOAH أن هذا الكشف يتم عادة بتضخيم RT-PCR.
مقارنة بالاختبارات الأخرى
الطرق الأكثر استخدامًا في الميدان ستكون، بحسب WOAH، تعريف IBV بتفاعل RT-PCR يليه تحديد التسلسل أو بتفاعلات RT-PCR خاصة بالأنماط الجينية، مع بقاء عزل الفيروس طريقة راسخة.
المنطقة المستهدفة
تقع المنطقة المستهدفة عادة في توصيف IBV في الوحدة الفرعية S1 من جين البروتين السكري S.
العينة
تُستخدم مسحات القصبة الهوائية أو المسحات الفموية البلعومية في الغالب عينةً مفضلة، لسهولة الحصول عليها ومعالجتها، بحسب WOAH.
الإجراء
تدعو WOAH، حتى عند استخدام مجموعات تجارية، إلى اختيار نظام استخلاص الحمض النووي الريبي (RNA) الأنسب والمصادق عليه للعينات المراد تحليلها، وتذكر أن هذا النظام يؤثر في نجاح التفاعل على العينات السريرية.
الحدود
لا تقدم اختبارات RT-PCR بصيغتها الحالية معلومات عن الإمراضية الفيروسية، بحسب WOAH.