تفاعل البوليميراز المتسلسل للجمرة الخبيثة

بحسب المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH)، تُستخدم اختبارات تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) في الجمرة الخبيثة (anthrax) لكشف Bacillus anthracis وتمييزه والتحقق من هويته، ويُختار الاختبار بحسب الغرض ومصدر العينة. وتتدرج هذه الاختبارات من صيغ يمكن استخدامها في التشخيص الروتيني إلى تقنيات تنميط جزيئي مناسبة للمختبرات المتخصصة.

ما الذي يكشفه

تستهدف الصيغ الآنية (real-time PCR) ثلاثة أهداف هي البلازميد pXO1 والبلازميد pXO2 والجينات الكروموسومية، لدى B. anthracis وأنواع Bacillus الوثيقة القرابة منه، وقد طُوِّرت لتعزيز سرعة الكشف وحساسيته ونوعيته.

متى يُستخدم

تقنيات التنميط الجزيئي، كتنميط تعدد أشكال النوكليوتيد المفرد القانوني (canonical SNP) وتحليل التكرارات الترادفية متغيرة العدد (VNTR)، مناسبة للاستخدام في المختبرات المتخصصة. أما التنميط القائم على تسلسل الجينوم الكامل، مثل التنميط متعدد المواقع للجينوم الأساسي (cgMLST)، فقد يفيد في توضيح تنوع الأنماط الجينية المتداولة وربط الفاشيات وتتبع سلسلة العدوى.

الأداء

قيّمت دراسة شاملة (Ågren et al., 2013) خمسة وثلاثين اختبارًا قائمًا على PCR لعشرين واسمًا كروموسوميًا، حاسوبيًا ومخبريًا. وكان اختبار PL3، الذي يستهدف جزءًا من العاثية الأولية من النمط 3، من أفضل الاختبارات أداءً فيها، ويمكن استخدامه في التشخيص الروتيني.

مقارنة بالاختبارات الأخرى

يمتد PCR إلى عينات يشق فيها الزرع: فاسترداد الجرثومة من الجيف المتحللة والمواد المصنَّعة والتربة الملوثة كثيرًا ما يتطلب إجراءات شاقة، بينما بدأت تظهر تقارير عن كشفها مباشرة في التربة وغيرها بتفاعل PCR. ويمكن اللجوء إلى PCR، بحسب WOAH، في العزلات التي يُشتبه في مقاومتها للمضاد الحيوي أو للعاثية.