تحديد تسلسل مقاطع بعينها من جينوم فيروس اللسان الأزرق (bluetongue virus, BTV) مطلوب، بحسب المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH)، للتعرّف النهائي القاطع على العزلة، مع أن طرق PCR تعطي تحديدًا سريعًا مبدئيًا لنمطها المصلي والجيني. يُجرى بالجمع بين تضخيم RT-PCR والتسلسل الشعري (capillary sequencing)، أو بتسلسل الجينوم الكامل (whole genome sequencing, WGS) الذي صار أيسر اقتصاديًا ويُطبَّق روتينيًا بصورة متزايدة.
تفسير النتيجة وحدوده
يتيح التسلسل التعرّف على العامل على مستوى الجينوم في وقت قصير نسبيًا. ويمكن حتى بين سلالات النمط المصلي الواحد تحديد المنشأ الجغرافي المرجح (topotype) لكل مقطع جيني. غير أن تركيز الفيروس في العزلات الحقلية قد يحدّ من فعالية التسلسل، وقد يلزم إنماء بعض العزلات في المزرعة الخلوية مسبقًا. وتدعو WOAH إلى الحذر عند تفسير نتائج العينات المنماة في المزرعة، فالتكيف مع المزرعة الخلوية ينطوي حتمًا على انتقاء الفيروسات القادرة على العدوى والتكاثر في النظام المستخدم. وقد لا تمثل التسلسلات الناتجة تمثيلًا تامًا مجموعة الفيروسات الموجودة في العينة التشخيصية الأصلية.