يتزايد استعمال طريقتين للتنميط الجيني (genotyping) لبكتيريا Coxiella burnetii، مسببة حمى كيو (Q fever)، تقومان على تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR)، هما تحليل التكرارات الترادفية متغيرة العدد متعدد المواقع (MLVA) والتنميط بتسلسل الفواصل المتعددة (MST). تتسم وبائيات حمى كيو بالتعقيد، كما يتضح من اتساع مدى عوائلها وقدرتها على البقاء في البيئة وانتقالها المحمول جوًا متعدد العوامل.
متى يُستخدم
تفيد أدوات التنميط في فهم العوامل الوبائية الناشئة، وتقل فائدتها عند تقييم تدابير المكافحة. تذكر المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) أن قواعد بيانات التنميط المتاحة تتيح المقارنة بين المختبرات بسهولة، وأن ذلك سيقود إلى فهم أفضل لانتشار عزلات C. burnetii أو إلى تحديد سلالات ناشئة جديدة.
القدرة التمييزية لطرق التنميط
تسمح طريقتا MLVA وMST بتنميط C. burnetii دون الحاجة إلى عزل الكائن، وتُعدّان حتى الآن أكثر الطرق تمييزًا لهذه البكتيريا إذ تحددان ما يصل إلى 36 نمطًا جينيًا متميزًا. يُعدّ التنميط بتعدد أشكال النوكليوتيد المفرد (SNP) طريقة موصوفة حديثًا، وتتواصل الأبحاث لتطوير أدوات جديدة مثله ومقارنة قدراتها التمييزية وقيمتها المعلوماتية.
حدود الاستعمال
يبدو توصيف العزلات ضروريًا لفهم تباين وبائيات حمى كيو بين المناطق الجغرافية، غير أن تقييم طرق التنميط التمييزية للوبائيات الجزيئية لا يزال جاريًا.