يُستخدم تفاعل البوليميراز المتسلسل (polymerase chain reaction, PCR)، مع السَّلسَلة (sequencing) عند الحاجة، لتحديد النوع والنمط الجيني الدقيقين لطفيلي داء المشوكات / الأكياس العدارية (echinococcosis; Echinococcus granulosus, E. multilocularis) باستخلاص الحمض النووي (DNA) من مادة مثبتة بالإيثانول أو مجمدة. يقدّم تحديد النمط الجيني للطفيلي معلومات مهمة عن دورات انتقال العدوى.
العينة
تذكر المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) أن التنميط الجيني يشترط وجود رؤيسات أولية (protoscoleces) أو قطع من الطبقة المنتشة (germinal layer). توصي المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) بشقّ الأكياس المستخرجة من الحيوانات بعد سحب سائلها، ونقل قطع من جدارها إلى إيثانول بتركيز 70%.
المبدأ
حُدّدت بادئات (primers) نوعية مبنية على جينات الميتوكوندريا (cox 1 وNAD1) والجينات الريبوسومية (12s) لجميع أنواع Echinococcus والشريطيات القريبة منها.
تفسير النتيجة
تؤكد المنظمة العالمية لصحة الحيوان أهمية تذكّر أن الحيوان الواحد قد يحمل عدوى مختلطة بأكثر من نمط جيني واحد من المشوكات.
السلامة الحيوية
تنصّ المنظمة العالمية لصحة الحيوان على التعامل مع العينات السريرية وبيض أنواع Echinococcus وفق إجراءات السلامة الحيوية والاحتواء المناسبة التي يحددها تحليل المخاطر الحيوية.
مقارنة بالاختبارات الأخرى
لا يمكن في ظروف الفحص البرازي المعتادة تمييز بيض Echinococcus عن بيض Taenia، في حين صار PCR يميّز بيض E. granulosus وE. multilocularis عن بيض الشريطيات (taeniids) الأخرى.