تفاعل البوليميراز المتسلسل الآني HS-est (real-time PCR) اختبار جزيئي طُوِّر على الجين المستهدف est للكشف النوعي عن طرز Pasteurella multocida المرتبطة بالتسمم الدموي النزفي (haemorrhagic septicaemia, HS). ويقدم كشفاً سريعاً ونوعياً لهذه الطرز تحديداً مقارنة بمقايسات PCR الأخرى.
ما الذي يكشفه
يستهدف الاختبار أربعة طرز تسلسل (sequence types, ST) مرتبطة بالمرض هي ST122 وST63 وST147 وST162. وهي الطرز نفسها التي أظهرها التنميط بتسلسل مواقع متعددة (MLST) لـ55 عزلة مرتبطة بالمرض، كان معظمها من ST122 (50 عزلة) ونادراً من الطرز الثلاثة الأخرى.
تفسير النتيجة وحدوده
وُصفت سلالات من الطراز ST151 ذات النمط المحفظي D معزولة من الخنازير، كانت إيجابية في PCR النوعي للنمط B المسبب للمرض، ولم يكشفها الاختبار الذي يستهدف الطرز الأربعة.
مقارنة بالاختبارات الأخرى
يختلف HS-est بذلك عن PCR النوعي للنمط B، الذي يعطي تعرفاً افتراضياً على النمط B المسبب للمرض بتضخيم قطعة من نحو 620 زوجاً قاعدياً (bp). ويختلف كذلك عن PCR النوعي للنوع، الذي يتعرف على جميع سُلَيلات (subspecies) P. multocida بدل طرز المرض بعينها.
مقايسات LAMP
أُبلغ حديثاً عن تطوير مقايسة Pm-LAMP ومقايسة HS-LAMP النوعية لسلالات الزمرة المصلية B:2 المرتبطة بالمرض في الأبقار والجواميس.
- تشير النتائج الأولية إلى حساسية ونوعية عاليتين لمقايسة HS-LAMP في كشف P. multocida المرتبطة بالمرض.
- ويُفترض أن تكون Pm-LAMP أداة تشخيصية مفيدة لكشف P. multocida كشفاً سريعاً مرئياً في مواد سريرية متنوعة من أنواع مضيفة مختلفة.