تفاعل البوليميراز المتسلسل (PCR) لفيروسي جدري الأغنام وجدري الماعز

sheep and goats (Caprinae)1 cited sources

تعدّ المنظمة العالمية لصحة الحيوان (WOAH) تفاعل البوليميراز المتسلسل (polymerase chain reaction, PCR) أسرع طريقة لتأكيد عدوى Capripoxvirus مخبريًا في جدري الأغنام وجدري الماعز (sheep pox and goat pox)، حين يقترن بتاريخ سريري يوافق عدوى معممة. يبقى الاختبار نوعيًا وحساسًا على امتداد سير المرض، ويكشف أجزاء جينوم Capripoxvirus في الخزعات والمسحات والدم والسائل المنوي ومزارع الخلايا.

العينة وصلاحية الطريقة لها

إلى جانب الآفات الظهارية (epithelial lesions) يمكن أخذ مسحات أنفية وفموية (buccal)، لأن الفيروس يوجد في الإفرازات الأنفية واللعاب. تؤكد WOAH أهمية التحقق من صلاحية طرق استخلاص الحمض النووي والتضخيم لنوع العينة (sample matrix) المفحوصة.

قراءة قيمة دورة العتبة (CT)

بحسب WOAH، تُعدّ العينات ذات قيمة دورة العتبة (CT) الأقل من 35 إيجابية، أما القيم الأكبر من 35 والأقل من 45 فغير حاسمة وتتطلب استقصاءً إضافيًا.

التمييز بين فيروس جدري الأغنام وفيروس جدري الماعز

تستهدف اختبارات عدة موضعًا وراثيًا صغيرًا محفوظًا في جينوم Capripoxvirus، لكنها لا تفرّق بين فيروس جدري الأغنام (SPPV) وفيروس جدري الماعز (GTPV) وفيروس مرض الجلد العقدي (LSDV). لهذا الغرض وُصف اختبار PCR تقليدي يميز فيروسي جدري الماعز ومرض الجلد العقدي من فيروس جدري الأغنام. تفيد طرق PCR التقليدية خصوصًا في الحصول على مادة وراثية كافية لتحديد النوع بتحليل التسلسل وشجرة النسب (phylogenetic analysis)، في حين وُصفت طرق PCR آنية تفرّق بين أنواع Capripoxvirus مباشرة دون حاجة إلى تحديد تسلسل الجينات.

اختبارات التضخيم متساوي الحرارة (LAMP)

أُبلغ عن تحقق ميداني من اختبار التضخيم متساوي الحرارة (LAMP) الذي وصفه Das وزملاؤه عام 2012 للكشف الشامل عن فيروسات Capripoxvirus، وعن تمييز فيروس جدري الماعز من فيروس جدري الأغنام بالجمع بين هذا الاختبار واختباري LAMP إضافيين.

How this test is classified